Một ngày nọ, cậu bé 10 tuổi Yamato và cô bạn Miku phát hiện một người đàn ông bị thương trong một con hẻm vắng. Người đàn ông này đã nhận ra Yamato, và sử dụng hơi thở cuối cùng của mình để chia sẻ cho Yamato một bí mật: Cha của Yamato chính là thủ phạm của vụ án bí ẩn nhất của thế kỉ 20. Một vài ngày sau, xác của cha Yamato được tìm thấy…Sáu năm sau, Yamato vẫn không thể ngừng tự hỏi về các sự cố, và quyết tâm hành động …